各市農業農村局、發展改革委、科技局、財政局、生態環境局:
為貫徹落實《國務院辦公廳關于加強農業種質資源保護與利用的意見》（國辦發〔2019〕56號）精神，加強我省農業種質資源有效保護，促進高效利用，結合我省實際，制定了《山東省農業種質資源保護與利用中長期發展規劃（2020-2035年）》,現印發給你們，請認真貫徹落實。
山東省農業農村廳 山東省發展和改革委員會
山東省科學技術廳 山東省財政廳
山東省生態環境廳
2020年9月14日
山東省農業種質資源保護與利用
中長期發展規劃
（2020—2035年）
農業種質資源是保障國家糧食安全與重要農產品供給的戰略性資源，是農業科技原始創新與現代種業發展的物質基礎。為貫徹落實《國務院辦公廳關于加強農業種質資源保護與利用的意見》（國辦發〔2019〕56號）精神，加強我省農業種質資源有效保護、促進高效利用，依據《中華人民共和國種子法》《中華人民共和國畜牧法》《中華人民共和國漁業法》《山東省種子條例》《全國農作物種質資源保護與利用中長期發展規劃（2015—2030年）》等，制訂本規劃。
一、規劃背景
（一）資源現狀。山東是農業大省，氣候、土壤和海洋等資源條件優越，農業歷史源遠流長，農業種質資源豐富，農業種質資源保護與利用工作取得了一定成效。
1.作物種質資源。山東省作物種質資源保護工作始于20世紀50年代，先后組織了兩次較大規模的作物種質資源收集工作，挽救了一大批瀕臨滅絕的地方品種、野生近緣種及特色資源。為提高作物種質資源的保護水平，全省建立了以4個中期庫、8個短期庫、5個試管苗庫為核心，30處種質資源圃為支撐，5個原生境保護區（點）為補充的作物種質資源保護體系。收集、引進、保存各類作物種質資源8萬余份，涵蓋21科67屬96種。對收集的3000多份果樹、桑樹和藥用植物等種質資源進行了圃地種植保存，對甘薯、馬鈴薯等無性繁殖資源進行離體保存，對保存的種質資源進行更新繁殖、農藝性狀鑒定、主要特征特性信息采集，篩選出一批高產、優質和抗逆性強的種質資源。對部分特異資源進行了分子標記、重要性狀基因發掘與鑒定，利用多樣化地方品種和野生近緣種中的優異特性，創制了一批新種質，拓寬了作物育種的遺傳基礎，增加了生物多樣性，有力支撐了農作物新品種選育、生命科學等基礎研究。
2.畜禽種質資源。山東省是畜禽遺傳資源大省，是全國畜禽遺傳資源最為豐富的省份之一，目前，全省有畜禽遺傳資源地方品種40個，其中14個已列入國家畜禽遺傳資源保護名錄。多年來，通過政府投資、政企結合及企業、個人投資等多種方式，全省建立了52個畜禽資源保種場、8個資源保護區、3個畜禽遺傳資源活體基因庫和1個省級畜禽遺傳材料基因庫。萊蕪豬等35個品種實現了保種場活體保護，魯西牛等3個品種實現了場區結合保護，都能達到保種的群體數量和血統要求；山東小毛驢、蒙山牛等瀕危資源建立了核心群與保種群；利用生物技術對利用價值大、個體優秀的畜禽品種進行了凍精、胚胎和組織材料的基因庫保存，省畜禽遺傳資源基因庫已集中收集保存牛、羊、豬等家畜遺傳物凍精、胚胎7萬余枚。
3.水產種質資源。山東省在水產生物種質資源保護與利用方面處于全國先進水平。建成了國內唯一的省級水產生物種質資源保存與利用平臺，最先啟動研發了基于計算機視覺的貝類智能識別系統，建立了活體庫（場）32處、標本庫4個、細胞庫2個、基因庫2個、網絡信息平臺1個、山東省水產生物數字博物館1個，保存海、淡水種質資源311種2168份。全省建立了46個國家級水產種質資源保護區、15個國家級水產原良種場、70個省級水產原良種場。以海帶、對蝦、扇貝、鲆鰈魚、海參為代表的人工育苗技術及全人工養成技術的突破，引領了我國海水養殖業的五次產業浪潮。
4.農業微生物種質資源。目前，依托科研院所、高校、菌種企業建立了小型食藥用菌菌種保藏中心（室）15處，采集野生食藥用菌實物標本6000余份，收集整理電子標本1000份，保存菌株6000余株。對保存的資源及時進行了繁種更新，基本遺傳性狀鑒定評價，補充完善了主要特征特性，篩選出了一批高產、優質、抗性良好的種質資源。完成1200余菌株的分子生物學特性鑒定，創制了一批新材料，拓寬了育種的遺傳基礎，培育出一批新品種，為農業特色產業發展提供品種支撐。
（二）存在問題。多年來，在農業種質資源保護與利用方面我省雖然取得了一定成效，但存在喪失風險加大，保護責任主體不清，開發利用不足等問題。
1.資源本底不清，特有資源消失風險加劇。隨著經濟社會發展和城鎮化進程推進，以及氣候變化、外來物種入侵、商品良種大面積推廣、國外畜禽品種引進等因素影響，大量地方品種消失，作物野生近緣植物資源急劇減少；山東省30年來未開展全省農業種質資源普查，缺乏完善的種質資源登記和統一管理制度，導致部分優異、特色資源未得到及時保護，處于瀕臨滅絕的危險。
2.種質資源保護體系與鑒定設施不完善。現有種質資源庫（圃、場）設施不完善，致使保存容量不足，覆蓋面不廣，畜禽遺傳資源種群數量偏少、家系不完善；分區域、分種類表型精準鑒定和規模化基因發掘缺乏平臺，野生資源原生境保護力度不夠。
3.基礎研究薄弱，系統鑒定與深度挖掘利用滯后。種質資源基礎性、前沿性研究較薄弱，理論與技術創新不深入，對現有資源的研究多數只局限于農藝（功能）性狀鑒定，表型精準鑒定、全基因水平基因型鑒定及新基因的發掘不夠，突破性創新資源缺乏，難以滿足新品種選育對優異種質和新基因的需求，支撐現代種業發展的能力不足。
4.配套政策不完善，共享利用效率低。資源保護責任主體不明確、缺乏持續穩定的資金支持、資源保護工作績效評價機制不科學、人才隊伍不穩定、資源共享機制不完善，智能化、信息化水平低，導致資源交流共享不暢，利用效率低。公益性保護與商業化利用之間缺少有效的紐帶，使得資源優勢尚未轉化為產業優勢和經濟優勢。
（三）發展趨勢。農業種質資源是搶占世界生物經濟戰略制高點、實現生命科學原始創新、增強和保持國家綜合競爭能力的重要物質保證，呈現出收集范圍全球化、資源管理系統化、保存設施現代化、技術規范標準化、共享服務信息化的發展趨勢，逐步形成了質量穩定、數量增加、開放合作、保存和利用水平不斷提高的農業種質資源保護體系。主要體現在四個方面：
一是產權保護力度越來越大。農業種質資源的知識產權保護從一般保護到依法保護，從種質資源主權保護到基因資源產權保護，呈現出多樣化、深入化發展態勢。
二是鑒定評價越來越深入。對種質資源進行規模化和精準化鑒定評價，發掘創制優異資源和關鍵基因，成為發展方向。
三是保護和鑒定體系越來越完善。世界大多數國家均建立了依據生態區布局，涵蓋收集、檢疫、保存、鑒定、種質創新等分工明確的農業種質資源國家公共保護和研究體系。在形態農藝性狀鑒定和編目的基礎上，建立和完善各類農業種質資源的核心種質庫（場），實現農業種質資源的安全、長期保存。
四是共享利用機制越來越健全。隨著《生物多樣性公約》《糧食和農業植物遺傳資源國際條約》等國際公約的實施，種質資源合作交流日益頻繁，資源獲取和利益分享建立機制，形成制度規范。
二、目標要求
（一）總體要求。根據農業科技原始創新和現代種業發展需求，以“在保護中有效利用”與“在利用中安全保存”為主題，建立基礎性、公益性、戰略性農業種質資源保護利用平臺，創新農業種質資源管理與共享機制，完善創新技術體系，解決資源庫（圃、場）收集、原位保護、異位保存和共享利用過程中的關鍵技術問題，規模化創制突破性新種質，使農業種質資源保存數量不斷增加、保存質量逐步提高、共享服務能力顯著增強，為山東省農業科技創新、生產可持續發展和種業強省建設提供支撐。
（二）基本原則
1.統籌規劃與分步實施相結合。農業種質資源門類多、分布廣，保存方式多樣，保護與利用是一項長期性工作，必須統籌規劃，突出重點，分步、分級、分類實施，積極穩妥推進全省農業種質資源保護與利用體系建設。
2.政府主導與社會參與相結合。以政府投入為主，發揮政府對公益性、基礎性事業的主導作用，充分調動科研院所、高等院校、社會團體、企業和個人參與的積極性，建立多元化的農業種質資源保護與利用體系。
3.技術創新與機制創新相結合。充分利用現代科學技術，研究建立資源高效安全保存和資源鑒定評價技術體系，為資源保護和利用提供技術支撐。創新資源管理體制和共享利用機制，為農業種質資源安全保護和高效利用提供制度保障。
4.有效保護與可持續利用相結合。立足于首先保護現有資源，同時，持續不斷收集新的優異資源，逐步擴大基因資源庫。緊密結合市場需求，有序開發利用特色資源，拓展可供利用的資源范圍和種類，創新保護與利用技術，在利用中保護農業種質資源。
（三）發展目標。到2035年，建成職責明確、布局合理、功能齊全、動態發展、監管規范、科學高效的國內一流省級農業種質資源安全保護、鑒定評價和共享利用三大體系，珍稀、瀕危、特有資源得到有效收集和保護，資源深度鑒定評價和綜合開發利用水平顯著提升，特色優異資源的創新利用達到國內先進水平。建設并完善作物種質資源保護庫（區、圃、基地）300個，實現資源保存總量15萬份，完成基因型鑒定1萬份，發掘和創制有重要育種價值的新種質500份。建設畜禽保種場（區、基因庫）80個，保存遺傳物質15萬枚（份），活體穩定保存25萬頭（只），完成功能性狀鑒定1萬頭（只），創制畜禽新品種（系）5個。建設水生生物種質資源保護區（場、基地）120個，保存種質資源1萬份，篩選并創制優質新種質50個，完成性狀表型和基因型鑒定3000份。保存食藥用菌等農業微生物種質資源1萬份。
三、主要任務
（一）農業種質資源普查與收集。組織開展農業種質資源全面普查、系統調查與搶救性收集，加快查清我省農業種質資源家底，完善保護名錄，實現應保盡保，確保資源不喪失。到2025年，完成全省農業縣（市、區）作物種質資源全面普查與收集，新收集保存各類古老、珍稀、特色、名優的作物品種5000份以上，作物種質資源總量達10萬份；對畜禽、水產、農業微生物種質資源開展普查與收集，畜禽遺傳材料保存總量達8萬枚（份），水產生物種質資源總量達5000份，食藥用菌等農業微生物種質資源總量達7000份。到2035年，作物種質資源總量達15萬份，畜禽遺傳物質總量達15萬枚（份），水產生物種質資源總量達1萬份，食藥用菌等農業微生物種質資源總量達1萬份。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省畜牧局、省農科院）
（二）農業種質資源登記。建立省級農業種質資源登記制度，啟動實施種質資源登記。按照統分結合、分級分類、共享交流、推進利用的原則，省農業農村主管部門負責農業種質資源分類登記工作，實行統一身份信息管理。登記工作優先從省級農業種質資源保護單位開展，逐步向科研院所、高等院校、社會組織和個人等其他登記主體延伸，到2025年完成現有種質資源登記工作。省農業農村主管部門定期發布種質資源登記信息，公布可供利用的種質資源目錄,有效保護創制人合法權益，激發種質資源創新的原動力。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省畜牧局、省農科院）
（三）農業種質資源引進與交換。鼓勵種質資源保存單位、品種選育單位走出去、請進來，多渠道、多形式加強國內外合作與交流，加大優異資源的引進和交換，創新農業種質資源交流利用機制。力爭每年引進優異作物種質資源3000份以上，優異畜禽遺傳材料2000枚（份）、優異水產種質資源100份，優異食藥用菌等農業微生物種質資源200份以上。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省畜牧局）
（四）農業種質資源保存與監測。對收集引進的農業種質資源進行保存和全面監測，作物種質資源開展基本農藝性狀鑒定、信息采集、編目入庫（圃），利用超低溫、DNA保存技術和活力監測、預警技術等，開展現存庫資源的活力與遺傳完整性監測，定期繁種更新，維持種質資源活力；開展畜禽保種場、基因庫種質資源動態監測和預警，確保遺傳資源保護利用有效；開展不同保存類型的水產種質資源，如活體、細胞、組織、胚胎、DNA等活力和數量監測，定期繁殖更新，保證庫存種質資源活力和安全。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省生態環境廳、省畜牧局）
（五）農業種質資源精準鑒定評價。以初選優異種質資源為
研究對象，在多個適宜生態區開展表型精準鑒定和綜合評價，篩選目標性狀優異的育種親本材料，并運用基因組學、生物信息學等理論和技術方法，對特異資源開展全基因組測序與功能基因研究，從基因水平發掘關鍵控制基因，發掘優異性狀關鍵基因及其有利等位基因，構建優異資源DNA圖譜。到2025年，完成作物、畜禽種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定各3000份，完成水產種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定1000份，完成食藥用菌等農業微生物種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定1000份。到2035年，完成作物、畜禽種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定各7000份，完成水產種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定3000份，完成食藥用菌等農業微生物種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定2000份，并開展表型和基因型關聯分析，篩選出具有應用價值的育種材料。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省發改委、省農科院）
（六）優異農業種質資源創制與應用。以含優異基因資源為供體，通過遠緣雜交、理化誘變、基因工程等技術，創制遺傳穩定、目標性狀突出、綜合性狀優良的新種質。建立基因快速檢測、轉移、聚合和追蹤的技術體系，促進創新種質的高效利用。到2035年，創制農業新種質575份，其中作物500份，畜禽5個，水產50個，食藥用菌等農業微生物20份。（牽頭單位：省科技廳，責任單位：省農業農村廳）
四、體系建設
（一）健全農業種質資源保護體系
為實現農業種質資源的長期安全保護，建立原生境(保護區)與非原生境（庫、圃、場）保護相結合、畜禽原位保護與異位集中保存相結合，與國家層次有機銜接的保護體系。在現有省農作物、畜禽、水產種質資源保存中心的基礎上，組建山東省農業種質資源保護與利用中心，擴建山東省農作物種質庫、畜禽遺傳資源基因庫和水產生物種質資源庫，新建種質資源保護場（圃）40個、畜禽保種場20個以上、省級水產原良種場20個，建立種質資源繁育鑒定基地35個，使我省種質資源保存利用綜合能力達到國內先進水平。有地方特色農業種質資源的市建設中期保存庫（圃）、保種場、保護區。以種質資源原生（產）地政府為實施主體，設立40處以上作物、畜禽、水產、農業微生物等種質資源原生境保護區，對我省特有的野生作物、水產生物、畜禽、食藥用菌等農業微生物品種資源進行原生境（原產地）保護。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省發改委、省科技廳、省財政廳、省生態環境廳、省畜牧局）
（二）建立農業種質資源精準鑒定評價體系
以優勢科研院所、高等院校為依托，搭建專業化、標準化、智能化資源鑒定評價與基因發掘技術平臺，開展高產、優質、抗逆、綠色、節本等重要經濟性狀形成機制、群體協同進化規律、基因組結構和功能多樣性研究，加快表型精準鑒定、基因型高通量鑒定、等位基因規模化發掘等深層次創新評價，強化育種創新基礎。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省發改委、省農科院）
（三）完善農業種質資源共享利用體系
構建農業種質資源大數據平臺，實現數字化動態監測、信息化監督管理。加強農業種質資源知識產權保護，制定農業種質資源共享利用保障規則，建立健全種質資源目錄公布機制、共享利用與信息反饋機制，提升種質資源利用效率。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省畜牧局、省農科院）
五、保障措施
（一）加強組織領導，落實主體責任
認真落實省級主管部門管理責任、市縣政府的屬地責任和農業種質資源保護單位的主體責任，明確省級作物、畜禽、水產、農業微生物等種質資源保護單位和野生植物原生境保護點。建立國家統籌、分級負責、有機銜接的農業種質資源管理保護機制。農業、發改、科技、財政、生態環境等有關部門要加強協調、密切合作，形成齊抓共推的強大合力，研究制定農業種質資源保護與利用相關政策，解決工作中出現的重大問題，切實推進全省農業種質資源保護與利用工作。
聘請國內相關領域的知名專家組成專家團隊，對農業種質資源保護利用中的重大問題提出咨詢意見與建議，為科學決策提供依據。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省發改委、省科技廳、省財政廳、省生態環境廳）
（二）完善法規政策，強化制度保障
制定完善山東省農業種質資源保護利用有關法規、政策、制度標準，全面規范農業種質資源收集、保存、鑒定、研究、開發、貿易、交換、進出境等活動。建立農業種質資源保護的生態補償機制，建立健全監測預警體系，及時掌握資源動態變化，科學預測發展趨勢，切實提升保護能力。建立種質資源登記、共享、產權保護等制度，規范種質獲取和信息反饋，強化知識產權保護，防止資源流失。推動種質資源相關技術納入科技成果掛牌交易或有償使用，提高資源共享利用效率。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省發改委、省科技廳、省財政廳、省生態環境廳、省畜牧局）
（三）加強資金支持，強化基礎保障
農業種質資源保護是一項公益性、長期性工作，各級財政按照事權和支出責任相匹配的原則，統籌相關資金，支持農業種質資源保護工作，確保種質資源工作的穩定性和連續性。農業種質資源新種質創制與開發利用納入省現代農業產業技術創新體系，現代種業提升工程、省農業良種工程、重點研發計劃、國際合作、自然科學基金等項目資金要加大對農業種質資源保護工作的支持力度。
市、縣、鄉政府要合理安排新建、改擴建農業種質資源庫（場、區、圃）用地。科學設置畜禽種質資源疫病防控緩沖區，不得擅自、超范圍將畜禽、水產保種場劃入禁養區，占用農業種質資源庫（場、區、圃）的，需經原設立機關批準。（牽頭單位：省財政廳，責任單位：省發改委、省生態環境廳、省科技廳、省農業農村廳、省畜牧局）
（四）創新評價機制，激勵人才隊伍
建立健全農業種質資源工作績效考核和人才評價機制，對從事種質資源收集保護、繁種更新、鑒定評價、分發共享等基礎性工作的科技人員實行同行評價。支持和鼓勵科研院所、高校建設農業種質資源相關學科，開展技術研究，培養專門人才。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳）
（五）加強宣傳教育、促進全社會參與
設立農業種質資源保護利用專題展示區（館）、科普基地，舉辦種質資源主題文化活動，充分發揮主流媒體、新媒體作用等，進行全方位多角度宣傳種質資源保護的重要意義、面臨的嚴峻形勢和法規政策，引導全社會關注和支持種質資源保護工作。營造保護農業種質資源人人有責的社會氛圍，把保護種質資源變成全社會的自覺行為。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省畜牧局）
為貫徹落實《國務院辦公廳關于加強農業種質資源保護與利用的意見》（國辦發〔2019〕56號）精神，加強我省農業種質資源有效保護，促進高效利用，結合我省實際，制定了《山東省農業種質資源保護與利用中長期發展規劃（2020-2035年）》,現印發給你們，請認真貫徹落實。
山東省農業農村廳 山東省發展和改革委員會
山東省科學技術廳 山東省財政廳
山東省生態環境廳
2020年9月14日
山東省農業種質資源保護與利用
中長期發展規劃
（2020—2035年）
農業種質資源是保障國家糧食安全與重要農產品供給的戰略性資源，是農業科技原始創新與現代種業發展的物質基礎。為貫徹落實《國務院辦公廳關于加強農業種質資源保護與利用的意見》（國辦發〔2019〕56號）精神，加強我省農業種質資源有效保護、促進高效利用，依據《中華人民共和國種子法》《中華人民共和國畜牧法》《中華人民共和國漁業法》《山東省種子條例》《全國農作物種質資源保護與利用中長期發展規劃（2015—2030年）》等，制訂本規劃。
一、規劃背景
（一）資源現狀。山東是農業大省，氣候、土壤和海洋等資源條件優越，農業歷史源遠流長，農業種質資源豐富，農業種質資源保護與利用工作取得了一定成效。
1.作物種質資源。山東省作物種質資源保護工作始于20世紀50年代，先后組織了兩次較大規模的作物種質資源收集工作，挽救了一大批瀕臨滅絕的地方品種、野生近緣種及特色資源。為提高作物種質資源的保護水平，全省建立了以4個中期庫、8個短期庫、5個試管苗庫為核心，30處種質資源圃為支撐，5個原生境保護區（點）為補充的作物種質資源保護體系。收集、引進、保存各類作物種質資源8萬余份，涵蓋21科67屬96種。對收集的3000多份果樹、桑樹和藥用植物等種質資源進行了圃地種植保存，對甘薯、馬鈴薯等無性繁殖資源進行離體保存，對保存的種質資源進行更新繁殖、農藝性狀鑒定、主要特征特性信息采集，篩選出一批高產、優質和抗逆性強的種質資源。對部分特異資源進行了分子標記、重要性狀基因發掘與鑒定，利用多樣化地方品種和野生近緣種中的優異特性，創制了一批新種質，拓寬了作物育種的遺傳基礎，增加了生物多樣性，有力支撐了農作物新品種選育、生命科學等基礎研究。
2.畜禽種質資源。山東省是畜禽遺傳資源大省，是全國畜禽遺傳資源最為豐富的省份之一，目前，全省有畜禽遺傳資源地方品種40個，其中14個已列入國家畜禽遺傳資源保護名錄。多年來，通過政府投資、政企結合及企業、個人投資等多種方式，全省建立了52個畜禽資源保種場、8個資源保護區、3個畜禽遺傳資源活體基因庫和1個省級畜禽遺傳材料基因庫。萊蕪豬等35個品種實現了保種場活體保護，魯西牛等3個品種實現了場區結合保護，都能達到保種的群體數量和血統要求；山東小毛驢、蒙山牛等瀕危資源建立了核心群與保種群；利用生物技術對利用價值大、個體優秀的畜禽品種進行了凍精、胚胎和組織材料的基因庫保存，省畜禽遺傳資源基因庫已集中收集保存牛、羊、豬等家畜遺傳物凍精、胚胎7萬余枚。
3.水產種質資源。山東省在水產生物種質資源保護與利用方面處于全國先進水平。建成了國內唯一的省級水產生物種質資源保存與利用平臺，最先啟動研發了基于計算機視覺的貝類智能識別系統，建立了活體庫（場）32處、標本庫4個、細胞庫2個、基因庫2個、網絡信息平臺1個、山東省水產生物數字博物館1個，保存海、淡水種質資源311種2168份。全省建立了46個國家級水產種質資源保護區、15個國家級水產原良種場、70個省級水產原良種場。以海帶、對蝦、扇貝、鲆鰈魚、海參為代表的人工育苗技術及全人工養成技術的突破，引領了我國海水養殖業的五次產業浪潮。
4.農業微生物種質資源。目前，依托科研院所、高校、菌種企業建立了小型食藥用菌菌種保藏中心（室）15處，采集野生食藥用菌實物標本6000余份，收集整理電子標本1000份，保存菌株6000余株。對保存的資源及時進行了繁種更新，基本遺傳性狀鑒定評價，補充完善了主要特征特性，篩選出了一批高產、優質、抗性良好的種質資源。完成1200余菌株的分子生物學特性鑒定，創制了一批新材料，拓寬了育種的遺傳基礎，培育出一批新品種，為農業特色產業發展提供品種支撐。
（二）存在問題。多年來，在農業種質資源保護與利用方面我省雖然取得了一定成效，但存在喪失風險加大，保護責任主體不清，開發利用不足等問題。
1.資源本底不清，特有資源消失風險加劇。隨著經濟社會發展和城鎮化進程推進，以及氣候變化、外來物種入侵、商品良種大面積推廣、國外畜禽品種引進等因素影響，大量地方品種消失，作物野生近緣植物資源急劇減少；山東省30年來未開展全省農業種質資源普查，缺乏完善的種質資源登記和統一管理制度，導致部分優異、特色資源未得到及時保護，處于瀕臨滅絕的危險。
2.種質資源保護體系與鑒定設施不完善。現有種質資源庫（圃、場）設施不完善，致使保存容量不足，覆蓋面不廣，畜禽遺傳資源種群數量偏少、家系不完善；分區域、分種類表型精準鑒定和規模化基因發掘缺乏平臺，野生資源原生境保護力度不夠。
3.基礎研究薄弱，系統鑒定與深度挖掘利用滯后。種質資源基礎性、前沿性研究較薄弱，理論與技術創新不深入，對現有資源的研究多數只局限于農藝（功能）性狀鑒定，表型精準鑒定、全基因水平基因型鑒定及新基因的發掘不夠，突破性創新資源缺乏，難以滿足新品種選育對優異種質和新基因的需求，支撐現代種業發展的能力不足。
4.配套政策不完善，共享利用效率低。資源保護責任主體不明確、缺乏持續穩定的資金支持、資源保護工作績效評價機制不科學、人才隊伍不穩定、資源共享機制不完善，智能化、信息化水平低，導致資源交流共享不暢，利用效率低。公益性保護與商業化利用之間缺少有效的紐帶，使得資源優勢尚未轉化為產業優勢和經濟優勢。
（三）發展趨勢。農業種質資源是搶占世界生物經濟戰略制高點、實現生命科學原始創新、增強和保持國家綜合競爭能力的重要物質保證，呈現出收集范圍全球化、資源管理系統化、保存設施現代化、技術規范標準化、共享服務信息化的發展趨勢，逐步形成了質量穩定、數量增加、開放合作、保存和利用水平不斷提高的農業種質資源保護體系。主要體現在四個方面：
一是產權保護力度越來越大。農業種質資源的知識產權保護從一般保護到依法保護，從種質資源主權保護到基因資源產權保護，呈現出多樣化、深入化發展態勢。
二是鑒定評價越來越深入。對種質資源進行規模化和精準化鑒定評價，發掘創制優異資源和關鍵基因，成為發展方向。
三是保護和鑒定體系越來越完善。世界大多數國家均建立了依據生態區布局，涵蓋收集、檢疫、保存、鑒定、種質創新等分工明確的農業種質資源國家公共保護和研究體系。在形態農藝性狀鑒定和編目的基礎上，建立和完善各類農業種質資源的核心種質庫（場），實現農業種質資源的安全、長期保存。
四是共享利用機制越來越健全。隨著《生物多樣性公約》《糧食和農業植物遺傳資源國際條約》等國際公約的實施，種質資源合作交流日益頻繁，資源獲取和利益分享建立機制，形成制度規范。
二、目標要求
（一）總體要求。根據農業科技原始創新和現代種業發展需求，以“在保護中有效利用”與“在利用中安全保存”為主題，建立基礎性、公益性、戰略性農業種質資源保護利用平臺，創新農業種質資源管理與共享機制，完善創新技術體系，解決資源庫（圃、場）收集、原位保護、異位保存和共享利用過程中的關鍵技術問題，規模化創制突破性新種質，使農業種質資源保存數量不斷增加、保存質量逐步提高、共享服務能力顯著增強，為山東省農業科技創新、生產可持續發展和種業強省建設提供支撐。
（二）基本原則
1.統籌規劃與分步實施相結合。農業種質資源門類多、分布廣，保存方式多樣，保護與利用是一項長期性工作，必須統籌規劃，突出重點，分步、分級、分類實施，積極穩妥推進全省農業種質資源保護與利用體系建設。
2.政府主導與社會參與相結合。以政府投入為主，發揮政府對公益性、基礎性事業的主導作用，充分調動科研院所、高等院校、社會團體、企業和個人參與的積極性，建立多元化的農業種質資源保護與利用體系。
3.技術創新與機制創新相結合。充分利用現代科學技術，研究建立資源高效安全保存和資源鑒定評價技術體系，為資源保護和利用提供技術支撐。創新資源管理體制和共享利用機制，為農業種質資源安全保護和高效利用提供制度保障。
4.有效保護與可持續利用相結合。立足于首先保護現有資源，同時，持續不斷收集新的優異資源，逐步擴大基因資源庫。緊密結合市場需求，有序開發利用特色資源，拓展可供利用的資源范圍和種類，創新保護與利用技術，在利用中保護農業種質資源。
（三）發展目標。到2035年，建成職責明確、布局合理、功能齊全、動態發展、監管規范、科學高效的國內一流省級農業種質資源安全保護、鑒定評價和共享利用三大體系，珍稀、瀕危、特有資源得到有效收集和保護，資源深度鑒定評價和綜合開發利用水平顯著提升，特色優異資源的創新利用達到國內先進水平。建設并完善作物種質資源保護庫（區、圃、基地）300個，實現資源保存總量15萬份，完成基因型鑒定1萬份，發掘和創制有重要育種價值的新種質500份。建設畜禽保種場（區、基因庫）80個，保存遺傳物質15萬枚（份），活體穩定保存25萬頭（只），完成功能性狀鑒定1萬頭（只），創制畜禽新品種（系）5個。建設水生生物種質資源保護區（場、基地）120個，保存種質資源1萬份，篩選并創制優質新種質50個，完成性狀表型和基因型鑒定3000份。保存食藥用菌等農業微生物種質資源1萬份。
三、主要任務
（一）農業種質資源普查與收集。組織開展農業種質資源全面普查、系統調查與搶救性收集，加快查清我省農業種質資源家底，完善保護名錄，實現應保盡保，確保資源不喪失。到2025年，完成全省農業縣（市、區）作物種質資源全面普查與收集，新收集保存各類古老、珍稀、特色、名優的作物品種5000份以上，作物種質資源總量達10萬份；對畜禽、水產、農業微生物種質資源開展普查與收集，畜禽遺傳材料保存總量達8萬枚（份），水產生物種質資源總量達5000份，食藥用菌等農業微生物種質資源總量達7000份。到2035年，作物種質資源總量達15萬份，畜禽遺傳物質總量達15萬枚（份），水產生物種質資源總量達1萬份，食藥用菌等農業微生物種質資源總量達1萬份。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省畜牧局、省農科院）
（二）農業種質資源登記。建立省級農業種質資源登記制度，啟動實施種質資源登記。按照統分結合、分級分類、共享交流、推進利用的原則，省農業農村主管部門負責農業種質資源分類登記工作，實行統一身份信息管理。登記工作優先從省級農業種質資源保護單位開展，逐步向科研院所、高等院校、社會組織和個人等其他登記主體延伸，到2025年完成現有種質資源登記工作。省農業農村主管部門定期發布種質資源登記信息，公布可供利用的種質資源目錄,有效保護創制人合法權益，激發種質資源創新的原動力。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省畜牧局、省農科院）
（三）農業種質資源引進與交換。鼓勵種質資源保存單位、品種選育單位走出去、請進來，多渠道、多形式加強國內外合作與交流，加大優異資源的引進和交換，創新農業種質資源交流利用機制。力爭每年引進優異作物種質資源3000份以上，優異畜禽遺傳材料2000枚（份）、優異水產種質資源100份，優異食藥用菌等農業微生物種質資源200份以上。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省畜牧局）
（四）農業種質資源保存與監測。對收集引進的農業種質資源進行保存和全面監測，作物種質資源開展基本農藝性狀鑒定、信息采集、編目入庫（圃），利用超低溫、DNA保存技術和活力監測、預警技術等，開展現存庫資源的活力與遺傳完整性監測，定期繁種更新，維持種質資源活力；開展畜禽保種場、基因庫種質資源動態監測和預警，確保遺傳資源保護利用有效；開展不同保存類型的水產種質資源，如活體、細胞、組織、胚胎、DNA等活力和數量監測，定期繁殖更新，保證庫存種質資源活力和安全。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省生態環境廳、省畜牧局）
（五）農業種質資源精準鑒定評價。以初選優異種質資源為
研究對象，在多個適宜生態區開展表型精準鑒定和綜合評價，篩選目標性狀優異的育種親本材料，并運用基因組學、生物信息學等理論和技術方法，對特異資源開展全基因組測序與功能基因研究，從基因水平發掘關鍵控制基因，發掘優異性狀關鍵基因及其有利等位基因，構建優異資源DNA圖譜。到2025年，完成作物、畜禽種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定各3000份，完成水產種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定1000份，完成食藥用菌等農業微生物種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定1000份。到2035年，完成作物、畜禽種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定各7000份，完成水產種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定3000份，完成食藥用菌等農業微生物種質資源表型精準鑒定和基因型鑒定2000份，并開展表型和基因型關聯分析，篩選出具有應用價值的育種材料。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省發改委、省農科院）
（六）優異農業種質資源創制與應用。以含優異基因資源為供體，通過遠緣雜交、理化誘變、基因工程等技術，創制遺傳穩定、目標性狀突出、綜合性狀優良的新種質。建立基因快速檢測、轉移、聚合和追蹤的技術體系，促進創新種質的高效利用。到2035年，創制農業新種質575份，其中作物500份，畜禽5個，水產50個，食藥用菌等農業微生物20份。（牽頭單位：省科技廳，責任單位：省農業農村廳）
四、體系建設
（一）健全農業種質資源保護體系
為實現農業種質資源的長期安全保護，建立原生境(保護區)與非原生境（庫、圃、場）保護相結合、畜禽原位保護與異位集中保存相結合，與國家層次有機銜接的保護體系。在現有省農作物、畜禽、水產種質資源保存中心的基礎上，組建山東省農業種質資源保護與利用中心，擴建山東省農作物種質庫、畜禽遺傳資源基因庫和水產生物種質資源庫，新建種質資源保護場（圃）40個、畜禽保種場20個以上、省級水產原良種場20個，建立種質資源繁育鑒定基地35個，使我省種質資源保存利用綜合能力達到國內先進水平。有地方特色農業種質資源的市建設中期保存庫（圃）、保種場、保護區。以種質資源原生（產）地政府為實施主體，設立40處以上作物、畜禽、水產、農業微生物等種質資源原生境保護區，對我省特有的野生作物、水產生物、畜禽、食藥用菌等農業微生物品種資源進行原生境（原產地）保護。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省發改委、省科技廳、省財政廳、省生態環境廳、省畜牧局）
（二）建立農業種質資源精準鑒定評價體系
以優勢科研院所、高等院校為依托，搭建專業化、標準化、智能化資源鑒定評價與基因發掘技術平臺，開展高產、優質、抗逆、綠色、節本等重要經濟性狀形成機制、群體協同進化規律、基因組結構和功能多樣性研究，加快表型精準鑒定、基因型高通量鑒定、等位基因規模化發掘等深層次創新評價，強化育種創新基礎。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省發改委、省農科院）
（三）完善農業種質資源共享利用體系
構建農業種質資源大數據平臺，實現數字化動態監測、信息化監督管理。加強農業種質資源知識產權保護，制定農業種質資源共享利用保障規則，建立健全種質資源目錄公布機制、共享利用與信息反饋機制，提升種質資源利用效率。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省畜牧局、省農科院）
五、保障措施
（一）加強組織領導，落實主體責任
認真落實省級主管部門管理責任、市縣政府的屬地責任和農業種質資源保護單位的主體責任，明確省級作物、畜禽、水產、農業微生物等種質資源保護單位和野生植物原生境保護點。建立國家統籌、分級負責、有機銜接的農業種質資源管理保護機制。農業、發改、科技、財政、生態環境等有關部門要加強協調、密切合作，形成齊抓共推的強大合力，研究制定農業種質資源保護與利用相關政策，解決工作中出現的重大問題，切實推進全省農業種質資源保護與利用工作。
聘請國內相關領域的知名專家組成專家團隊，對農業種質資源保護利用中的重大問題提出咨詢意見與建議，為科學決策提供依據。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省發改委、省科技廳、省財政廳、省生態環境廳）
（二）完善法規政策，強化制度保障
制定完善山東省農業種質資源保護利用有關法規、政策、制度標準，全面規范農業種質資源收集、保存、鑒定、研究、開發、貿易、交換、進出境等活動。建立農業種質資源保護的生態補償機制，建立健全監測預警體系，及時掌握資源動態變化，科學預測發展趨勢，切實提升保護能力。建立種質資源登記、共享、產權保護等制度，規范種質獲取和信息反饋，強化知識產權保護，防止資源流失。推動種質資源相關技術納入科技成果掛牌交易或有償使用，提高資源共享利用效率。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省發改委、省科技廳、省財政廳、省生態環境廳、省畜牧局）
（三）加強資金支持，強化基礎保障
農業種質資源保護是一項公益性、長期性工作，各級財政按照事權和支出責任相匹配的原則，統籌相關資金，支持農業種質資源保護工作，確保種質資源工作的穩定性和連續性。農業種質資源新種質創制與開發利用納入省現代農業產業技術創新體系，現代種業提升工程、省農業良種工程、重點研發計劃、國際合作、自然科學基金等項目資金要加大對農業種質資源保護工作的支持力度。
市、縣、鄉政府要合理安排新建、改擴建農業種質資源庫（場、區、圃）用地。科學設置畜禽種質資源疫病防控緩沖區，不得擅自、超范圍將畜禽、水產保種場劃入禁養區，占用農業種質資源庫（場、區、圃）的，需經原設立機關批準。（牽頭單位：省財政廳，責任單位：省發改委、省生態環境廳、省科技廳、省農業農村廳、省畜牧局）
（四）創新評價機制，激勵人才隊伍
建立健全農業種質資源工作績效考核和人才評價機制，對從事種質資源收集保護、繁種更新、鑒定評價、分發共享等基礎性工作的科技人員實行同行評價。支持和鼓勵科研院所、高校建設農業種質資源相關學科，開展技術研究，培養專門人才。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳）
（五）加強宣傳教育、促進全社會參與
設立農業種質資源保護利用專題展示區（館）、科普基地，舉辦種質資源主題文化活動，充分發揮主流媒體、新媒體作用等，進行全方位多角度宣傳種質資源保護的重要意義、面臨的嚴峻形勢和法規政策，引導全社會關注和支持種質資源保護工作。營造保護農業種質資源人人有責的社會氛圍，把保護種質資源變成全社會的自覺行為。（牽頭單位：省農業農村廳，責任單位：省科技廳、省畜牧局）
