發酵是生物實驗重要的工具。它是微生物自身生產或直接利用微生物進行有氧厭氧生物活性代謝的過程。生物發酵罐廣泛應用于乳制品、飲料生物工程、制藥、精細化工等行業，乳制品和酒類進行發酵處理。
發酵罐的應用涉及到其細菌的復雜控制，控制其他細菌在發酵過程的影響。如果發酵過程污染細菌，會嚴重影響發酵過程，導致發酵過程的產量下降，更嚴重的可能會導致整個發酵過程的失敗，發酵產品不能滿足的需求，整個發酵過程的失敗。因此我們要注意采取滅菌操作。由于工業操作的特點，發酵罐滅菌傳統普遍采用濕熱滅菌法。
然而，發酵罐采用濕熱滅菌法，也存在一些弊端，因為影響濕熱滅菌的主要因素有：微生物的種類與數量、蒸汽的性質、產品性質和滅菌時間等。例如采用流通蒸氣滅菌法：是指在常壓條件下，采用100攝氏度流通蒸氣加熱殺滅微生物的方法，滅菌時間通常為30-60分鐘。該法適用于消毒以及不耐高熱制劑的滅菌，但不能保證殺滅所有芽孢，是非可靠的滅菌方法。
所以說，發酵罐滅菌，對芽孢的殺滅是一個難點。芽孢本身的特質是：的含水率接近40% ，較低的水分是其能夠抵御外界不良因素的主要原因，其次具有多糖類構成的致密孢子壁，是抵御不良物質的屏障，在萌發后會變成細胞壁芽孢在化學成分上也與其營養細胞有差異，尤其是芽孢中含有營養細胞所沒有的DPA-Ca(吡啶二羧酸鈣)，該物質會使芽孢中的生命大分子物質形成穩定而耐熱性強的凝膠，其耐熱性隨著DPA-Ca的消失而消失，被認為是芽孢耐熱的主要根源。
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