4月10日，Plant Communications（中科院一區Top ，IF = 10.5）在線發表了題為“Telomere-to-telomere cultivated and wild soybean genome assembly provides insights into evolution and domestication under structural variation”的論文。
該研究結合PacBio、ONT和Hi-C測序，獲得了從山東省采集的野生大豆及栽培大豆（“鄆豆1號”）端粒到端粒高質量的基因組序列，首次發現大豆著絲粒區域存在384bp（CentGm384）和981bp（CentGm981）的特定串聯重復序列，并在已公開發表的“ZH13”、“Wm82”及“jack”栽培大豆基因組序列中得到印證。
進一步結合結構變異和單核苷酸變異，分析確認了栽培大豆和野生大豆已經分化為兩個不同的群體，栽培大豆的遺傳多樣性低于野生大豆，與氮代謝調控相關的基因在栽培大豆的馴化過程中受到人為選擇。這些發現不僅為我們理解大豆的馴化歷史提供了新的視角，也為未來大豆的分子育種和遺傳改良提供了重要的基因資源和選擇靶標。
我院種質資源所為論文第一完成單位，論文由農作物種質資源收集保存和評價創新團隊主導完成。該研究得到國家自然科學基金面上項目、山東省重點研發、山東省自然科學基金青年基金、山東省農科院創新工程的資助。（撰稿：賈凱華、夏晗，核稿：李娜娜）
文章鏈接：https://www.cell.com/plant-communications/fulltext/S2590-3462（24）00189-5
日期：2024-04-22
該研究結合PacBio、ONT和Hi-C測序，獲得了從山東省采集的野生大豆及栽培大豆（“鄆豆1號”）端粒到端粒高質量的基因組序列，首次發現大豆著絲粒區域存在384bp（CentGm384）和981bp（CentGm981）的特定串聯重復序列，并在已公開發表的“ZH13”、“Wm82”及“jack”栽培大豆基因組序列中得到印證。
進一步結合結構變異和單核苷酸變異，分析確認了栽培大豆和野生大豆已經分化為兩個不同的群體，栽培大豆的遺傳多樣性低于野生大豆，與氮代謝調控相關的基因在栽培大豆的馴化過程中受到人為選擇。這些發現不僅為我們理解大豆的馴化歷史提供了新的視角，也為未來大豆的分子育種和遺傳改良提供了重要的基因資源和選擇靶標。
我院種質資源所為論文第一完成單位，論文由農作物種質資源收集保存和評價創新團隊主導完成。該研究得到國家自然科學基金面上項目、山東省重點研發、山東省自然科學基金青年基金、山東省農科院創新工程的資助。（撰稿：賈凱華、夏晗，核稿：李娜娜）
文章鏈接：https://www.cell.com/plant-communications/fulltext/S2590-3462（24）00189-5
日期：2024-04-22
