近日,中國農業科學院油料所芝麻與特色油料遺傳育種創新團隊成功構建了五個高質量的染色體水平的芝麻參考基因組,并在全基因組水平鑒定了芝麻自然群體結構變異,發現了調控芝麻株型和產量性狀的候選基因,揭示了芝麻株型和產量相關性狀變異的分子基礎。該項研究成果發表在國際知名學術刊物《植物生物技術(Plant Biotechnology Journal)》上。
該團隊首席、文章通訊作者王林海研究員介紹,該研究通過整合二代、三代測序數據,實現了五個代表性芝麻品種基因組的從頭組裝,為芝麻研究提供了五個高質量的參考基因組,結合214份芝麻種質的自然群體重測序分析,發現了與芝麻株型和產量性狀相關的結構變異,并發掘出兩個能同時調控芝麻分枝和每葉腋蒴果數的多效性候選基因,為分析芝麻基因組結構和進化、重要性狀基因發掘與等位基因鑒定提供了寶貴的基因組資源和有效的方法。
上述研究得到了中國農科院科技創新工程、國家特色油料產業技術體系建設專項等項目的資助。該團隊出站博士后宋勝楠、在站博士后法蘭克(Senouwa Segla Koffi Dossou)和華中農業大學博士研究生孟明輝為論文共同第一作者,王林海研究員和游均副研究員為共同通訊作者。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/pbi.14092
日期:2023-06-25
該團隊首席、文章通訊作者王林海研究員介紹,該研究通過整合二代、三代測序數據,實現了五個代表性芝麻品種基因組的從頭組裝,為芝麻研究提供了五個高質量的參考基因組,結合214份芝麻種質的自然群體重測序分析,發現了與芝麻株型和產量性狀相關的結構變異,并發掘出兩個能同時調控芝麻分枝和每葉腋蒴果數的多效性候選基因,為分析芝麻基因組結構和進化、重要性狀基因發掘與等位基因鑒定提供了寶貴的基因組資源和有效的方法。
上述研究得到了中國農科院科技創新工程、國家特色油料產業技術體系建設專項等項目的資助。該團隊出站博士后宋勝楠、在站博士后法蘭克(Senouwa Segla Koffi Dossou)和華中農業大學博士研究生孟明輝為論文共同第一作者,王林海研究員和游均副研究員為共同通訊作者。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/pbi.14092
日期:2023-06-25