近日，中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室在魚類種質(zhì)資源基因標(biāo)記開發(fā)方面取得新進(jìn)展，相關(guān)成果以“FishPIE: A universal phylogenetically informative exon markers set for ray-finned fishes”發(fā)表于Cell旗下期刊《iScience》。
依托國家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫珠江分庫（掛靠單位中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所）保存的魚類基因資源和數(shù)據(jù)資源，從131種魚類基因組數(shù)據(jù)中篩選出直系同源基因，通過對31個目203個物種的PCR引物特異性和PCR擴(kuò)增效率進(jìn)行進(jìn)一步篩選，初步開發(fā)了82個魚類通用型核基因分子標(biāo)記（FishPIE），并構(gòu)建了魚類60個目190個科710種魚類的系統(tǒng)發(fā)育樹，得到了與使用數(shù)百個標(biāo)記的系統(tǒng)發(fā)育研究相當(dāng)?shù)姆直媛省Ｐ聵?biāo)記的開發(fā)應(yīng)用，可以實現(xiàn)對魚類種質(zhì)的快速分類和鑒定，在保障準(zhǔn)確率的前提下，降低了現(xiàn)有技術(shù)耗時、費(fèi)力、成本高的問題，同時為魚類系統(tǒng)發(fā)育提供了一種新方案，豐富了基于分子標(biāo)記對魚類系統(tǒng)發(fā)育研究的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃（2018YFD0900705），中國-東盟海上合作基金（CAMC-2018F））和國家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫（FGRC18537）等項目資助。牟希東、楊葉欣和孫金輝為共同第一作者，牟希東和中山大學(xué)馬嘉欣為共同通訊作者。
原文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004222012974
日期：2022-11-01
依托國家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫珠江分庫（掛靠單位中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所）保存的魚類基因資源和數(shù)據(jù)資源，從131種魚類基因組數(shù)據(jù)中篩選出直系同源基因，通過對31個目203個物種的PCR引物特異性和PCR擴(kuò)增效率進(jìn)行進(jìn)一步篩選，初步開發(fā)了82個魚類通用型核基因分子標(biāo)記（FishPIE），并構(gòu)建了魚類60個目190個科710種魚類的系統(tǒng)發(fā)育樹，得到了與使用數(shù)百個標(biāo)記的系統(tǒng)發(fā)育研究相當(dāng)?shù)姆直媛省Ｐ聵?biāo)記的開發(fā)應(yīng)用，可以實現(xiàn)對魚類種質(zhì)的快速分類和鑒定，在保障準(zhǔn)確率的前提下，降低了現(xiàn)有技術(shù)耗時、費(fèi)力、成本高的問題，同時為魚類系統(tǒng)發(fā)育提供了一種新方案，豐富了基于分子標(biāo)記對魚類系統(tǒng)發(fā)育研究的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃（2018YFD0900705），中國-東盟海上合作基金（CAMC-2018F））和國家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫（FGRC18537）等項目資助。牟希東、楊葉欣和孫金輝為共同第一作者，牟希東和中山大學(xué)馬嘉欣為共同通訊作者。
原文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004222012974
日期：2022-11-01
