近日,西北農林科技大學動物科技學院曾文先教授團隊在豬精原干細胞研究中取得新進展,相關成果以“Unraveling three-dimensional chromatin structural dynamics during spermatogonial differentiation”為題,在《Journal of Biological Chemistry》發表。動科學院鄭以副教授、博士研究生張令鍇、張鵬飛及四川農業大學金龍副教授為共同第一作者,曾文先教授、四川農業大學李明洲教授為共同通訊作者。我校為第一完成單位。
豬精原干細胞分化過程中染色質三維空間結構對基因表達的調控示例
該研究以豬為模型,利用Hi-C、ChIP-seq和RNA-seq等技術,系統探究了精原干細胞和分化精原細胞的染色質三維空間結構,并進一步闡明了精原干細胞分化過程中的高級染色質動態變化。首次發現精原干細胞分化伴隨著染色質高級結構的減弱,直至其后的減數分裂階段染色質高級結構消失,從三維基因組層面證實了精原細胞分化的實質是為進入減數分裂做準備;進一步發現精原干細胞分化過程中染色質高級結構A/B區室和拓撲關聯結構域(TAD)與基因的動態表達相關。此外,首次在5kb分辨率下解析了啟動子-增強子互作(PEI)對基因表達的調控機制,鑒定出了精原干細胞分化過程中受PEI調控的重要基因。
研究首次明確了精原干細胞分化過程中的染色質三維空間結構變化及其對基因表達的重要調控作用,極大地拓展了對精原干細胞發育進程的認知。研究結果對揭示精原干細胞分化的分子機制具有重要意義,可為精原干細胞體外誘導分化為功能性精子奠定基礎,從而為轉基因動物的制作開辟新的途徑。
該研究國家、學校等項目的資助。
原文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925821013697?via%3Dihub
日期:2022-01-05
豬精原干細胞分化過程中染色質三維空間結構對基因表達的調控示例
該研究以豬為模型,利用Hi-C、ChIP-seq和RNA-seq等技術,系統探究了精原干細胞和分化精原細胞的染色質三維空間結構,并進一步闡明了精原干細胞分化過程中的高級染色質動態變化。首次發現精原干細胞分化伴隨著染色質高級結構的減弱,直至其后的減數分裂階段染色質高級結構消失,從三維基因組層面證實了精原細胞分化的實質是為進入減數分裂做準備;進一步發現精原干細胞分化過程中染色質高級結構A/B區室和拓撲關聯結構域(TAD)與基因的動態表達相關。此外,首次在5kb分辨率下解析了啟動子-增強子互作(PEI)對基因表達的調控機制,鑒定出了精原干細胞分化過程中受PEI調控的重要基因。
研究首次明確了精原干細胞分化過程中的染色質三維空間結構變化及其對基因表達的重要調控作用,極大地拓展了對精原干細胞發育進程的認知。研究結果對揭示精原干細胞分化的分子機制具有重要意義,可為精原干細胞體外誘導分化為功能性精子奠定基礎,從而為轉基因動物的制作開辟新的途徑。
該研究國家、學校等項目的資助。
原文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925821013697?via%3Dihub
日期:2022-01-05