9月17日,Molecular Biology and Evolution(IF5-y=13.401)在線發表江蘇省農業科學院果樹所草莓研究室趙密珍團隊與中國科學院華南植物園的合作研究成果,揭示森林草莓和飯沼草莓是八倍體栽培草莓的二倍體祖先,而綠色草莓、黃毛草莓和西藏草莓并非其二倍體祖先。這一結果破解了半個多世紀以來栽培草莓的起源之爭,結束了近一年半Nature Genetics(IF5-y=30.331)三篇論文的“口水戰”。
從上世紀起,栽培草莓的起源一直為科學家所困擾。2011年美國佛羅里達大學研究團隊首次確定森林草莓是八倍體栽培草莓的一個二倍體祖先,揭開了八倍體栽培草莓起源的神秘面紗,之后日本、英國、美國、中國多家團隊展開科研競賽。2019年2月美國加州大學及合作者在Nature Genetics上發表論文,推測八倍體栽培草莓有4個不同的二倍體祖先:森林草莓、飯沼草莓、綠色草莓和日本草莓;2020年1月俄勒岡州立大學及合作者基于同套數據在Nature Genetics上認為,僅可確定八倍體草莓的兩個二倍體祖先:森林草莓和飯沼草莓;同期美國加州大學及合作者在Nature Genetics上給予反擊,堅持己見。一時間,硝煙四起,讀者迷茫。
果樹所與華南植物園從2017年起合作開展綠色草莓、黃毛草莓和西藏草莓染色體級別的全基因序列組裝,結合已發表的高質量森林草莓、飯沼草莓基因組,利用比較基因組和sppIDer(新的基于測序數據的物種鑒定工具)方法,解釋了不同團隊基于同一套數據,采用不同參數或方法得出截然不同結論的原因,證實了八倍體栽培草莓的真正起源。
果樹所王靜研究員與華南植物園馮超博士為論文共同第一作者,趙密珍和華南植物園康明研究員為論文共同通訊作者。
日期:2020-09-27
從上世紀起,栽培草莓的起源一直為科學家所困擾。2011年美國佛羅里達大學研究團隊首次確定森林草莓是八倍體栽培草莓的一個二倍體祖先,揭開了八倍體栽培草莓起源的神秘面紗,之后日本、英國、美國、中國多家團隊展開科研競賽。2019年2月美國加州大學及合作者在Nature Genetics上發表論文,推測八倍體栽培草莓有4個不同的二倍體祖先:森林草莓、飯沼草莓、綠色草莓和日本草莓;2020年1月俄勒岡州立大學及合作者基于同套數據在Nature Genetics上認為,僅可確定八倍體草莓的兩個二倍體祖先:森林草莓和飯沼草莓;同期美國加州大學及合作者在Nature Genetics上給予反擊,堅持己見。一時間,硝煙四起,讀者迷茫。
果樹所與華南植物園從2017年起合作開展綠色草莓、黃毛草莓和西藏草莓染色體級別的全基因序列組裝,結合已發表的高質量森林草莓、飯沼草莓基因組,利用比較基因組和sppIDer(新的基于測序數據的物種鑒定工具)方法,解釋了不同團隊基于同一套數據,采用不同參數或方法得出截然不同結論的原因,證實了八倍體栽培草莓的真正起源。
果樹所王靜研究員與華南植物園馮超博士為論文共同第一作者,趙密珍和華南植物園康明研究員為論文共同通訊作者。
日期:2020-09-27