近日，中國水產科學研究院珠江水產研究所淡水蝦遺傳育種于凌云研究團隊在羅氏沼蝦基因組解析領域取得重要進展。其研究成果以 “A high-quality chromosome-level genome assembly and annotation of the giant freshwater prawn （Macrobrachium rosenbergii）” 為題，正式在線發表于國際知名專業期刊《Scientific Data》（JCR 1區）。該研究由于凌云副研究員和劉海洋博士共同擔任第一作者，王亞坤博士和朱新平研究員為共同通訊作者。
羅氏沼蝦作為全球重要的商業淡水蝦品種，憑借肉質細膩、味道鮮美、營養豐富的特點廣受市場青睞。近年來，我國羅氏沼蝦養殖產業規模持續擴大，2023 年養殖產量已近 20 萬噸。然而，疾病頻發、種質退化等瓶頸問題嚴重制約了產業的可持續發展。在此背景下，開展羅氏沼蝦精準遺傳改良，培育兼具多種優良性狀的復合型新品種，以滿足日益增長的品質需求，成為突破產業發展瓶頸的關鍵路徑。但長期以來，由于缺乏高質量的基因組資源，羅氏沼蝦的種質改良工作整體進展相對遲緩。
針對這一難題，于凌云研究團隊運用 PacBio HiFi 長讀長測序及 Hi-C 等先進技術，成功攻克了羅氏沼蝦基因組高雜合度、高重復序列占比以及大基因組規模組裝等技術難題，最終繪制高質量的羅氏沼蝦基因組圖譜。該基因組大小為 2.96 Gb，其中 94.37% 的序列已成功錨定到 59 條染色體上，并鑒定得到 27,111 個蛋白質編碼基因，完成 25,470 個基因的功能注釋。此研究是繼成功構建 “臻珠 1 號” 羅氏沼蝦 200K 育種芯片和指紋圖譜等成果后取得的又一突破，不僅為羅氏沼蝦功能基因組學研究和分子育種工作提供了基因資源，更為推動羅氏沼蝦種質創新、加速產業高質量發展奠定了堅實的技術支撐。
全文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41597-025-05494-8
日期：2025-07-25
羅氏沼蝦作為全球重要的商業淡水蝦品種，憑借肉質細膩、味道鮮美、營養豐富的特點廣受市場青睞。近年來，我國羅氏沼蝦養殖產業規模持續擴大，2023 年養殖產量已近 20 萬噸。然而，疾病頻發、種質退化等瓶頸問題嚴重制約了產業的可持續發展。在此背景下，開展羅氏沼蝦精準遺傳改良，培育兼具多種優良性狀的復合型新品種，以滿足日益增長的品質需求，成為突破產業發展瓶頸的關鍵路徑。但長期以來，由于缺乏高質量的基因組資源，羅氏沼蝦的種質改良工作整體進展相對遲緩。
針對這一難題，于凌云研究團隊運用 PacBio HiFi 長讀長測序及 Hi-C 等先進技術，成功攻克了羅氏沼蝦基因組高雜合度、高重復序列占比以及大基因組規模組裝等技術難題，最終繪制高質量的羅氏沼蝦基因組圖譜。該基因組大小為 2.96 Gb，其中 94.37% 的序列已成功錨定到 59 條染色體上，并鑒定得到 27,111 個蛋白質編碼基因，完成 25,470 個基因的功能注釋。此研究是繼成功構建 “臻珠 1 號” 羅氏沼蝦 200K 育種芯片和指紋圖譜等成果后取得的又一突破，不僅為羅氏沼蝦功能基因組學研究和分子育種工作提供了基因資源，更為推動羅氏沼蝦種質創新、加速產業高質量發展奠定了堅實的技術支撐。
全文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41597-025-05494-8
日期：2025-07-25
