3月12日，Horticulture Research（中科院一區，IF：8.7）以封面文章（2024年第2期）在線發表了院園藝研究所/岳麓山實驗室果樹品種創制中心聯合華中農業大學果蔬園藝作物種質創新與利用全國重點實驗室和中國農業科學院深圳農業基因組所合作完成的題為《Phased genomics reveals hidden somatic mutations and provides insight into fruit development in sweet orange》的研究論文。
該研究從頭組裝了二倍體“錦和”冰糖橙的高質量單倍型基因組。與前期參考基因組比較，本研究組裝出了10.6%的新序列。甜橙基因組的兩套單倍型具有顯著序列差異，干擾了體細胞變異的準確檢測。本研究開發出一種基于單倍型鑒定體細胞變異的方法，結合甜橙無性系的基因組重測序數據，構建了二倍體甜橙體細胞變異的完整圖譜。通過對一組遺傳背景高度一致、果實大小差異顯著的體細胞變異品種“錦和”冰糖橙進行轉錄組測序分析。結合體細胞變異圖譜和等位基因特異表達分析，鎖定了與果實大小發育緊密相關的雜合體細胞變異，對于甜橙育種改良具有重要意義。
“錦和”冰糖橙是院園藝研究所最新選育的高糖低酸、優質大果型冰糖橙新品種。2023年11月28日中國柑桔學會組織相關專家對該新品種進行了現場測產和綜合評議，測量結果顯示其平均單果重超過200克，平均縱橫徑均超過70厘米，無核、低酸，風味較“錦和”濃郁。專家組一致認為“錦和”冰糖橙遺傳性狀穩定，果大、味濃、綜合性狀優良，是一個有發展前景的優系。本研究為我國地方特色良種冰糖橙新品種選育提供了理論指導，同時為柑橘果實大小發育研究提供了參考。
作者團隊介紹：湖南省農業科學院園藝研究所為第一完成單位，園藝所陳鵬副研究員和華中農業大學徐強教授為論文的共同通訊作者，中國農業科學院深圳農業基因組所博士后王楠，園藝所許園園為論文的共同第一作者。華中農業大學鄧秀新院士、伊華林教授和Robert M. Larkin教授，基因組所周永鋒研究員，園藝所李先信研究員、郭玲霞博士等參與了該研究。該研究得到國家重點研發項目（2022YFF1003100，2019YFD1001400）、湖南省農業科技創新資金項目（2022CX127，2023CX71）和湖南省自然科學基金項目（2021JJ40308）資助。
論文鏈接：https://doi.org/10.1093/hr/uhad268
日期：2024-03-15
該研究從頭組裝了二倍體“錦和”冰糖橙的高質量單倍型基因組。與前期參考基因組比較，本研究組裝出了10.6%的新序列。甜橙基因組的兩套單倍型具有顯著序列差異，干擾了體細胞變異的準確檢測。本研究開發出一種基于單倍型鑒定體細胞變異的方法，結合甜橙無性系的基因組重測序數據，構建了二倍體甜橙體細胞變異的完整圖譜。通過對一組遺傳背景高度一致、果實大小差異顯著的體細胞變異品種“錦和”冰糖橙進行轉錄組測序分析。結合體細胞變異圖譜和等位基因特異表達分析，鎖定了與果實大小發育緊密相關的雜合體細胞變異，對于甜橙育種改良具有重要意義。
“錦和”冰糖橙是院園藝研究所最新選育的高糖低酸、優質大果型冰糖橙新品種。2023年11月28日中國柑桔學會組織相關專家對該新品種進行了現場測產和綜合評議，測量結果顯示其平均單果重超過200克，平均縱橫徑均超過70厘米，無核、低酸，風味較“錦和”濃郁。專家組一致認為“錦和”冰糖橙遺傳性狀穩定，果大、味濃、綜合性狀優良，是一個有發展前景的優系。本研究為我國地方特色良種冰糖橙新品種選育提供了理論指導，同時為柑橘果實大小發育研究提供了參考。
作者團隊介紹：湖南省農業科學院園藝研究所為第一完成單位，園藝所陳鵬副研究員和華中農業大學徐強教授為論文的共同通訊作者，中國農業科學院深圳農業基因組所博士后王楠，園藝所許園園為論文的共同第一作者。華中農業大學鄧秀新院士、伊華林教授和Robert M. Larkin教授，基因組所周永鋒研究員，園藝所李先信研究員、郭玲霞博士等參與了該研究。該研究得到國家重點研發項目（2022YFF1003100，2019YFD1001400）、湖南省農業科技創新資金項目（2022CX127，2023CX71）和湖南省自然科學基金項目（2021JJ40308）資助。
論文鏈接：https://doi.org/10.1093/hr/uhad268
日期：2024-03-15
