近日，中國農業科學院蔬菜花卉研究所分子育種創新團隊研究獲得接近完整組裝的白菜基因組，揭示白菜著絲粒的快速進化特征。相關研究成果在線發表在《植物生物技術（Plant Biotechnology Journal）》上。
白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一，是我國栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個完成基因組測序的物種，白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎。但是，目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個缺口，其10條染色體的著絲粒結構組裝均不完整。
該團隊利用三代測序技術，獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補了白菜基因組中絕大多數缺口，完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝，僅有2條染色體仍存在一個缺口；該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。研究還發現，著絲粒區域長末端重復序列的平均插入時間為14萬年，顯著晚于泛著絲粒區域，表明白菜的著絲粒區域經歷著快速進化。
該研究得到國家重點研發計劃、中國農業科學院科技創新工程項目等項目的支持。（通訊員：陳旭）
原文鏈接：
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14015
日期：2023-02-17
白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一，是我國栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個完成基因組測序的物種，白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎。但是，目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個缺口，其10條染色體的著絲粒結構組裝均不完整。
該團隊利用三代測序技術，獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補了白菜基因組中絕大多數缺口，完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝，僅有2條染色體仍存在一個缺口；該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。研究還發現，著絲粒區域長末端重復序列的平均插入時間為14萬年，顯著晚于泛著絲粒區域，表明白菜的著絲粒區域經歷著快速進化。
該研究得到國家重點研發計劃、中國農業科學院科技創新工程項目等項目的支持。（通訊員：陳旭）
原文鏈接：
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14015
日期：2023-02-17
