近日，中國熱科院椰子所在檳榔果實脫落調控研究方面取得新進展，首次從基因組水平上系統鑒定了檳榔DOF基因家族成員，并提出了其與檳榔果實早期脫落過程的關系，該研究為進一步解析檳榔果實脫落的分子調控機制奠定了基礎。
檳榔（Areca catechu L.）是海南重要的經濟作物，幼果異常脫落嚴重影響產量，是檳榔種植產業中亟待解決的問題。果實脫落由多種環境和發育信號所觸發，研究團隊前期通過轉錄組分析發現DOF基因家族成員在幼果脫落過程中表達量出現顯著變化。DOF（DNA binding with one finger）基因家族是一類植物特有的轉錄因子，它屬于鋅指蛋白超家族（zinc finger super-family）。本研究對檳榔AcDOFs進行了全基因組分析，分析了其基因結構、系統發生關系、啟動子區域、染色體位置和共線性。同時觀察了檳榔果實在脫落前后離層的細胞結構變化，并比較了“即將脫落”與“未脫落”的離層區域中AcDOFs基因轉錄水平，在果實離層中鑒定出6個關鍵的AcDOF基因，并進一步將其中3個AcDOFs鑒定為與果實脫落進程相關的關鍵基因。
研究進一步利用TF （Transcription Factor）-Centered Yeast One Hybrid技術篩選到了關鍵基因AcDOF4可能識別并結合的33個motifs，這些motifs存在于一些已知的、與脫落有關的基因啟動子區域，包括編碼纖維素合酶、果膠甲酯酶、聚半乳糖醛酸酶、伸展蛋白等基因。與預測一致的是，這些基因在“即將脫落”與“未脫落”果實離層中表達差異顯著。以上結果為深入研究檳榔DOF家族基因的生物學功能、解析檳榔果實脫落的分子調控機制研究奠定了基礎。
該成果以“Genome-wide identification of the DOF gene family involved in fruitlet abscission in Areca catechu L.”為題發表于《International Journal of Molecular Sciences》。中國熱科院椰子所李佳助理研究員為這篇文章的第一作者，中南林業科技大學李萌副教授為通訊作者。該項工作得到了海南省重點研發專項等項目經費的支持。
文章鏈接： https://doi.org/10.3390/ijms231911768
日期：2022-10-24
檳榔（Areca catechu L.）是海南重要的經濟作物，幼果異常脫落嚴重影響產量，是檳榔種植產業中亟待解決的問題。果實脫落由多種環境和發育信號所觸發，研究團隊前期通過轉錄組分析發現DOF基因家族成員在幼果脫落過程中表達量出現顯著變化。DOF（DNA binding with one finger）基因家族是一類植物特有的轉錄因子，它屬于鋅指蛋白超家族（zinc finger super-family）。本研究對檳榔AcDOFs進行了全基因組分析，分析了其基因結構、系統發生關系、啟動子區域、染色體位置和共線性。同時觀察了檳榔果實在脫落前后離層的細胞結構變化，并比較了“即將脫落”與“未脫落”的離層區域中AcDOFs基因轉錄水平，在果實離層中鑒定出6個關鍵的AcDOF基因，并進一步將其中3個AcDOFs鑒定為與果實脫落進程相關的關鍵基因。
研究進一步利用TF （Transcription Factor）-Centered Yeast One Hybrid技術篩選到了關鍵基因AcDOF4可能識別并結合的33個motifs，這些motifs存在于一些已知的、與脫落有關的基因啟動子區域，包括編碼纖維素合酶、果膠甲酯酶、聚半乳糖醛酸酶、伸展蛋白等基因。與預測一致的是，這些基因在“即將脫落”與“未脫落”果實離層中表達差異顯著。以上結果為深入研究檳榔DOF家族基因的生物學功能、解析檳榔果實脫落的分子調控機制研究奠定了基礎。
該成果以“Genome-wide identification of the DOF gene family involved in fruitlet abscission in Areca catechu L.”為題發表于《International Journal of Molecular Sciences》。中國熱科院椰子所李佳助理研究員為這篇文章的第一作者，中南林業科技大學李萌副教授為通訊作者。該項工作得到了海南省重點研發專項等項目經費的支持。
文章鏈接： https://doi.org/10.3390/ijms231911768
日期：2022-10-24
