近日，豬遺傳育種創新團隊繪制了涵蓋豬胚胎發育全期骨骼肌基因組染色質開放區域精細圖譜，鑒定了調節肌肉發育的順式調控元件及相關基因，為更好地研究豬胚胎骨骼肌發育相關基因的調控動力學奠定了基礎。相關研究成果發表在《畜牧與生物技術雜志（Journal of Animal Science and Biotechnology）》上。
據團隊執行首席張龍超博士介紹，豬胚胎肌肉發育主要集中在兩個生長波，即胚胎期35-60天，初級纖維形成；胚胎期54-90天，次級纖維生成。發育過程中，大量轉錄因子通過與開放的靶基因DNA序列結合來調控基因轉錄的發生，進而控制骨骼肌發育進程。但由于豬胚胎期骨骼肌基因組范圍染色質開放性尚不清晰，豬經濟性狀分子機理解析及基因組育種技術創新受到制約。為攻克這一瓶頸問題，研究人員以大白豬為研究對象，利用ATAC-seq、RNA-seq等多種組學研究技術，獲得了包含45、70和100胚齡時期骨骼肌表觀遺傳調控數據，并在三個胚胎時期分別鑒定出21,638、35,447和60,181個染色體開放區域。研究還發現數個調控肌肉發育相關基因的轉錄因子以及大量轉錄阻遏物，為豬功能基因組及性狀調控機制研究提供了重要參考。
該研究得到中國農業科學院創新工程、國家生豬產業技術體系的資助。
原文鏈接https://doi.org/10.1186/s40104-021-00577-z
日期：2021-05-20
據團隊執行首席張龍超博士介紹，豬胚胎肌肉發育主要集中在兩個生長波，即胚胎期35-60天，初級纖維形成；胚胎期54-90天，次級纖維生成。發育過程中，大量轉錄因子通過與開放的靶基因DNA序列結合來調控基因轉錄的發生，進而控制骨骼肌發育進程。但由于豬胚胎期骨骼肌基因組范圍染色質開放性尚不清晰，豬經濟性狀分子機理解析及基因組育種技術創新受到制約。為攻克這一瓶頸問題，研究人員以大白豬為研究對象，利用ATAC-seq、RNA-seq等多種組學研究技術，獲得了包含45、70和100胚齡時期骨骼肌表觀遺傳調控數據，并在三個胚胎時期分別鑒定出21,638、35,447和60,181個染色體開放區域。研究還發現數個調控肌肉發育相關基因的轉錄因子以及大量轉錄阻遏物，為豬功能基因組及性狀調控機制研究提供了重要參考。
該研究得到中國農業科學院創新工程、國家生豬產業技術體系的資助。
原文鏈接https://doi.org/10.1186/s40104-021-00577-z
日期：2021-05-20
