11月17日，中國水稻研究所種質創新課題組在國際學術期刊Journal of Experimental Botany在線發表了題為“The Rice LRR-Like1Protein YELLOW AND PREMATURE DWARF 1 is Involved in High Light-Induced LeafSenescence”的研究論文。該論文通過圖位克隆及各種遺傳學分析首次克隆了一個水稻LRR-Like1編碼基因，并揭示了LRR樣蛋白與植物葉綠體降解和衰老的相互關系。
LRR （leucine-rich repeat）是一個由20-30個氨基酸組成的富含亮氨酸的重復序列，包含兩個或多個LRR串聯重復序列的蛋白質和結構域構成LRR超家族，具有多種功能，如細胞粘附和信號傳遞、細胞外基質組裝、血小板聚集、神經元發育、RNA處理、病原菌對宿主細胞的粘附和入侵、植物的抗病性和病原識別等。但LRR樣蛋白與植物葉片衰老的相互關系在植物，尤其是水稻中尚缺乏研究。
前期，作者從EMS突變體庫中發現了兩個苗期黃化，抽穗期早衰的等位突變體，命名為yellow andpremature dwarf 1 （ypd1）。該突變體在強光下會加速細胞死亡和衰老。
圖位克隆結果表明ypd1突變表型是由LOC_Os06g13050上發生的移碼突變引起。RGAP預測LOC_Os06g13050編碼一個過氧化物酶（PAO）家族蛋白。以該基因第一外顯子上的一段序列為靶點，構建的定點突變體并未如預期對水稻表型產生影響，cDNA全長擴增也無法獲得其N端的部分序列，由此研究人員推斷LOC_Os06g13050可能并不是RGAP中預測的PAO家族蛋白。
野生型日本晴中實際擴增獲得的YPD1 cDNA全長序列可以回補ypd1的突變表型。與RGAP的預測相比，實際擴增獲得的cDNA缺乏N端的第一、二外顯子，研究人員對該序列翻譯后發現YPD1編碼的是一個新的蛋白，同源性分析結果表明其可能編碼一個含有CARD 3亞型（caspase recruitment domain）結構域的NLR家族蛋白（NLRC3），該蛋白在動物中被廣泛研究，主要參與動物的免疫反應，但在植物中鮮有報道。將YPD1與不同物種的NLRC3保守結構域進行比對分析，發現其結構與動物和魚類等典型的NLRC3結構有很大不同。YPD1缺乏NLRC3特有的CARD和NBD結構域，只有14個LRR重復結構域，并且包含一個負責葉綠體膜定位的N-末端。為此，研究人員將YPD1重新命名為LRR-Like1（LRRL1）蛋白。
該研究首次闡明了LRR樣蛋白在水稻葉綠體發育和葉片衰老中的作用，高光會進一步加速突變體內葉綠體的降解，進而造成葉片早衰的表型。這些結果為深入理解水稻高光損傷及葉綠體、光合機構穩定性提供了理論支撐。
研究得到浙江高層次人才和國家自然科學基金等項目資助。陳冬東碩士和德州學院的邱振楠博士為論文的共同第一作者，朱麗研究員、曾大力研究員和錢前院士為共同通訊作者，
論文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33200773/
日期：2020-11-20
LRR （leucine-rich repeat）是一個由20-30個氨基酸組成的富含亮氨酸的重復序列，包含兩個或多個LRR串聯重復序列的蛋白質和結構域構成LRR超家族，具有多種功能，如細胞粘附和信號傳遞、細胞外基質組裝、血小板聚集、神經元發育、RNA處理、病原菌對宿主細胞的粘附和入侵、植物的抗病性和病原識別等。但LRR樣蛋白與植物葉片衰老的相互關系在植物，尤其是水稻中尚缺乏研究。
前期，作者從EMS突變體庫中發現了兩個苗期黃化，抽穗期早衰的等位突變體，命名為yellow andpremature dwarf 1 （ypd1）。該突變體在強光下會加速細胞死亡和衰老。
圖位克隆結果表明ypd1突變表型是由LOC_Os06g13050上發生的移碼突變引起。RGAP預測LOC_Os06g13050編碼一個過氧化物酶（PAO）家族蛋白。以該基因第一外顯子上的一段序列為靶點，構建的定點突變體并未如預期對水稻表型產生影響，cDNA全長擴增也無法獲得其N端的部分序列，由此研究人員推斷LOC_Os06g13050可能并不是RGAP中預測的PAO家族蛋白。
野生型日本晴中實際擴增獲得的YPD1 cDNA全長序列可以回補ypd1的突變表型。與RGAP的預測相比，實際擴增獲得的cDNA缺乏N端的第一、二外顯子，研究人員對該序列翻譯后發現YPD1編碼的是一個新的蛋白，同源性分析結果表明其可能編碼一個含有CARD 3亞型（caspase recruitment domain）結構域的NLR家族蛋白（NLRC3），該蛋白在動物中被廣泛研究，主要參與動物的免疫反應，但在植物中鮮有報道。將YPD1與不同物種的NLRC3保守結構域進行比對分析，發現其結構與動物和魚類等典型的NLRC3結構有很大不同。YPD1缺乏NLRC3特有的CARD和NBD結構域，只有14個LRR重復結構域，并且包含一個負責葉綠體膜定位的N-末端。為此，研究人員將YPD1重新命名為LRR-Like1（LRRL1）蛋白。
該研究首次闡明了LRR樣蛋白在水稻葉綠體發育和葉片衰老中的作用，高光會進一步加速突變體內葉綠體的降解，進而造成葉片早衰的表型。這些結果為深入理解水稻高光損傷及葉綠體、光合機構穩定性提供了理論支撐。
研究得到浙江高層次人才和國家自然科學基金等項目資助。陳冬東碩士和德州學院的邱振楠博士為論文的共同第一作者，朱麗研究員、曾大力研究員和錢前院士為共同通訊作者，
論文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33200773/
日期：2020-11-20
