近日，廣東省農業科學院作物所科技人員在國際著名期刊《Plant Biotechnology Journal》 （JCR一區，IF9.803）在線發表花生單細胞基因表達研究成果，在國際上首次繪制了花生葉片單細胞基因表達圖譜。作物所劉浩博士，聯合培養研究生胡冬秀、杜普旋為共同第一作者。作物所洪彥彬研究員、陳小平研究員，國際半干旱熱帶作物研究所Rajeev Varshney院士為共同通訊作者。
花生是我國重要的油料經濟作物，栽培種花生為異源四倍體豆科作物，開展花生功能基因表達研究具有重要意義。作物所花生團隊在前期開展花生二倍體野生種、四倍體栽培種全基因組測序解研究結果的基礎上，再利用單細胞測序技術（scRNA-seq）對花生葉片細胞的基因表達譜進行研究。單細胞測序轉錄組測序（Single-cell RNA sequencing）是近年來研究基因表達量的新方法，與傳統的組織轉錄組測序（Tissue Bulk RNA sequencing）相比，可在單個細胞內研究基因表達之間的異質性問題。
本研究建立了穩定的花生葉片原生質體細胞分離方法，并利用scRNA-seq技術捕獲了6815個細胞，構建了第一張花生單細胞基因表達圖譜。此外，對花生葉肉細胞與葉片細胞的擬時序發育軌跡進行了分析，并鑒定到了重要的轉錄因子AHL23（AT-hook transcription factor）。本研究獲得了廣東省重點研發計劃、國家自然科學青年基金、廣東省國際合作項目、廣東省基礎與應用基礎研究項目、國家現代農業產業技術體系、廣東省農業科學院“十四五”農業優勢產業學科團隊、廣東省農業科學院人才培養專項等項目的支持。
原文連接https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/pbi.13656
單細胞測序技術鑒定花生葉片亞細胞類型
花生葉肉細胞與表皮細胞擬時序發育軌跡及發育模型
日期：2021-07-05
花生是我國重要的油料經濟作物，栽培種花生為異源四倍體豆科作物，開展花生功能基因表達研究具有重要意義。作物所花生團隊在前期開展花生二倍體野生種、四倍體栽培種全基因組測序解研究結果的基礎上，再利用單細胞測序技術（scRNA-seq）對花生葉片細胞的基因表達譜進行研究。單細胞測序轉錄組測序（Single-cell RNA sequencing）是近年來研究基因表達量的新方法，與傳統的組織轉錄組測序（Tissue Bulk RNA sequencing）相比，可在單個細胞內研究基因表達之間的異質性問題。
本研究建立了穩定的花生葉片原生質體細胞分離方法，并利用scRNA-seq技術捕獲了6815個細胞，構建了第一張花生單細胞基因表達圖譜。此外，對花生葉肉細胞與葉片細胞的擬時序發育軌跡進行了分析，并鑒定到了重要的轉錄因子AHL23（AT-hook transcription factor）。本研究獲得了廣東省重點研發計劃、國家自然科學青年基金、廣東省國際合作項目、廣東省基礎與應用基礎研究項目、國家現代農業產業技術體系、廣東省農業科學院“十四五”農業優勢產業學科團隊、廣東省農業科學院人才培養專項等項目的支持。
原文連接https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/pbi.13656
單細胞測序技術鑒定花生葉片亞細胞類型
花生葉肉細胞與表皮細胞擬時序發育軌跡及發育模型
日期：2021-07-05
