根據市政府辦公廳相關文件規定，食品安全標準管理職責由市質監部門劃入市衛生行政部門，并于4月1日起辦理食品安全企業標準備案。為規范食品安全企業標準備案和食品安全地方標準管理工作，市衛生局制定了《北京市食品安全企業標準備案辦法（試行）》和《北京市食品安全地方標準管理辦法（試行）》，現已發布，在4月1日起實施。
兩個辦法具有以下特點：
一、突出安全性，以保障公眾健康為宗旨
備案范圍為食品生產企業食品安全企業標準，包括兩種情形，一是沒有食品安全國家標準或者北京市地方標準的；二是嚴于食品安全國家標準或者北京市地方標準的。
與食品安全無關的內容和指標，不屬于食品安全企業標準備案的內容。
制定食品安全地方標準的范圍，主要包括以下方面：
（一）食品生產經營過程的衛生要求；
?。ǘ┡c食品安全有關的檢驗方法；
?。ㄈ┻m宜制定食品安全地方標準的食品；
（四）其他需要制定食品安全地方標準的內容。
根據相關規定，本市不制定有關食品添加劑、食品相關產品、新資源食品、保健食品的食品安全地方標準，這些食品安全標準由國務院衛生行政部門統一制定。
二、堅持公開透明原則，組織廣泛參與
備案后的食品安全企業標準文本在北京衛生信息網（http://www.bjhb.gov.cn/）供公眾免費查閱。
鼓勵公民、法人和其他組織參與食品安全地方標準制（修）訂工作，提出食品安全地方標準立項建議。具備相應技術能力的食品安全技術機構、監督機構、研究機構、教育機構、學術團體、行業協會等均可承擔食品安全地方標準的起草工作。
地方標準起草完成后，標準起草單位應當廣泛征求監管部門、標準使用單位、科研院校、行業和企業、消費者、專家等方面的意見。標準草案，在北京衛生信息網上（http://www.bjhb.gov.cn/）公開征求意見，期限一般為兩個月。
三、堅持方便企業，服務企業
按照《食品安全法》規定，食品安全企業標準由市衛生行政部門備案。為方便企業辦理備案，我市食品安全企業標準備案工作實行分級辦理、逐步到位的工作模式。一般食品備案受理由區縣衛生監督所承擔，受理地點在區縣的統一行政許可服務中心。受理后由區縣衛生監督機構負責將備案材料移交市衛生監督所辦理備案，備案后由區縣衛生監督機構向企業發放備案憑證。
2013年4月1日之前已經在質量監督部門備案的企業標準，在備案有效期內繼續有效，不需要重新向市衛生行政部門報送備案。但按規定需要重新備案或注銷的除外。
四、加強企業標準備案以后和地方標準實施以后的管理
食品安全企業標準備案以后，除供公眾免費查閱，接受公眾監督外，還建立了四種加強事后管理的制度，一是五種情況下企業需要主動對已經備案的標準進行復審；二是有 八種情況備案部門應當注銷食品安全企業標準備案號；三是任何單位和個人發現備案的食品安全企業標準存在問題的，有權向衛生行政部門舉報；四是企業在食品安全企業標準備案中弄虛作假的，除注銷備案外，將弄虛作假的行為向社會通報，并將企業的不良不法行為納入信用管理體系。
食品安全地方標準實施后，市衛生行政部門將組織開展跟蹤評價，根據跟蹤評價結果，適時對地方標準進行復審，需要修訂的納入修訂立項計劃。
