組織采用該標準的益處至少涉及到以下幾方面：
(1)可以與貿易伙伴進行有組織的、有針對性的溝通：
(2)在組織內部及食品鏈中實現(xiàn)資源利用最優(yōu)化；
(3)改善文獻資源管理；
(4)加強計劃性，減少過程后的檢驗；
(5)更加有效和動態(tài)的進行食品安全風險控制；
(6)所有的控制措施都將進行風險分析；
(7)對必備方案進行系統(tǒng)化管理：
(8)由于關注最終結果，該標準適用范圍廣泛；
(9)可以作為決策的有效依據(jù)；
(10)充分提高勤奮度：
(11)聚焦于對必要的問題的控制；
(12)通過減少冗余的系統(tǒng)審計而節(jié)約資源。
其他利益相關方獲得的好處包括：
能夠信任采用該標準的組織有能力識別和控制食品安全風險。
此外，以下原因也可以增加該標準的價值：
(1)是國際性的：
(2)為協(xié)調各國國家標準提供了可能；
(3)食品加工者正期待該標準；
(4)為整個食品鏈提供了參考：
(5)為第一方認證提供了框架；
(6)彌補了IS09001：2000和HACCP的不足；
(7)為更好地理解和進一步發(fā)展HACCP藥典做出了貢獻；
(8)具有清晰要求的可供審核的標準；
(9)采用系統(tǒng)方法而不是產品方法，從而適用于管理者。
