2014年9月3日，臺灣地區“衛生福利部”發布部授食字第1031302284號令，制定“基因改造食品咨議會設置辦法”全文十條，如下：
第一條 本辦法依食品安全衛生管理法（以下簡稱本法）第四條第四項規定訂定。
第二條 基因改造食品咨議會（以下簡稱本會）的任務，為就下列基因改造食品管理與監督相關事項的咨詢或建議：
一、基因改造食品政策及策略的訂定。
二、基因改造食品計劃的研定。
三、其它有關基因改造食品事項。
第三條 本會置委員十三人至十七人，由“衛生福利部”（以下簡稱本部）部長就食品衛生、營養、分子生物、醫學、毒理、農業、法律等學者專家聘兼之。
前項委員，其中任一性別不得少于委員總數三分之一。
本部部長就第一項委員中聘請一人為召集人，另一人為副召集人。
委員任期三年，期滿可續聘。委員因故無法完成任期者，可另遴聘兼之，其繼任者任期至原委員任期屆滿之日止。
第四條 本會置執行秘書一人，工作人員若干人，辦理本會業務，由本部部長就“衛生福利部食品藥物管理署”（以下簡稱食藥署）相關業務人員派兼之。
第五條 本會會議以每年召開二次為原則，必要時可召開臨時會議，應有全體委員過半數出席，始得開會。
第六條 本會會議由召集人擔任主席；召集人不克出席時，由副召集人代理的；召集人及副召集人均未能出席時，由召集人指定委員一人為主席；不克指定時，由出席委員互相推舉。
第七條 本會委員的回避事項，依行政程序法的規定。
第八條 本會開會時，可視需要，邀請相關專家學者、機關代表及食藥署相關單位人員列席。
第九條 本會委員及列席人員對會議資料、委員意見或會議結論應予保密，不得泄漏。
前項會議結論經依行政程序核定后，可由“食藥署”公開。
第十條 本辦法自發布日施行。
日期：2014-09-05
