近來陰雨天多，地溫低，土壤濕度大，棉花苗期病害發生嚴重，并且為多種病害同株發生，形成混合癥狀，導致棉花播種后要么爛種、爛芽，要么因病死苗，使棉田缺苗斷壟，不利于棉花壯苗早發。因此，雨后棉田管理要抓緊。
棉苗出土前遇雨，因土壤板結影響出苗，雨后要抓緊耙地或劃鋤松土，發現爛種、爛芽，需及時補種、移苗。
棉苗出土后遇雨，雨后應及時中耕劃鋤，以提高地溫，降低土壤濕度，促進根系發育。同時要及時噴藥防病，可噴施惡霉靈、甲基托布津、多菌靈等內吸性殺菌劑800~1500倍液加棉花苗期專用型天達2116、天豐素等抗低溫葉面肥。
低洼積水棉田，雨后要及時排水，并配合松土散墑噴施殺菌劑及葉面肥。
泥濘、病害嚴重的棉田，可先揭膜、松土，采取近株開溝散墑及株間松土的方法，然后用惡霉靈、菌絕、乙蒜素、多菌靈等的1000~1500倍液進行灌根，每株50~100毫升，每7天一次，連灌2~3次。
缺苗斷壟處，采取缺3株補2株、缺2株補1株的方法移栽，缺苗、死苗嚴重的建議抓緊時間補種魯棉研19等夏棉品種。
