使用魚藥物，首先要根據魚病的原因和發病部位來決定治療方法。還要視水溫、魚的忍耐度等靈活掌握，不同品種魚類的魚病，使用不同的藥物。
1、正確測量魚池面積、水深，計算魚池水量，從而計算總用藥量。此外，有些藥物不能混合使用，如敵百蟲不能和生石灰混用，有些藥物保管不妥或過長，容易失效，因此，藥物最好是現配現用。
2、在潑灑藥物的同時，最好不要投喂飼料，一般要先喂食，后潑藥。
3、用藥時如果是水位淺水質瘦，藥效作用快，可適當減少藥量，特別是硫酸銅，瘦水池應特別注意減少用藥量，避免產生藥害。
4、池塘潑灑藥物，一定要均勻，對不易溶解的藥物，應充分使其溶解后再全池潑灑。
5、潑灑藥物最好在晴天上午九時或下午四時左右進行，避免在中午陽光直射時施用，否則會降低藥物的效果。若在夏季潑灑藥物，宜在下午4-5時進行。用藥時應注意魚浮頭時不能用藥，用藥時如遇陰雨天氣，可用增氧機增氧1小時后潑灑。
6、全池潑灑藥物時，應從上風處開始逐漸向下風潑，這樣開始潑濃度較大，但隨著風力的作用，藥液會很快在池中分布均勻。
