棉籽餅因含有游離棉酚，易引起畜禽中毒。棉籽餅的常用去毒方法為：
（1）取草木灰或生石灰適量加入１００千克清水中攪拌均勻，沉淀后取上清夜浸泡棉籽餅，餅液比例為２：１，浸泡２４小時后再用清水濾液３～４遍，即可飼用。
（2）在每百公斤土榨棉籽餅中加硫酸亞鐵１.２～１.５千克，機榨粕只需加０.１５～０ .２千克，再以適量清水浸泡４～６小時，就可飼喂。
（3）用２％的碳酸氫銨或ｌ％的尿素溶液均勻噴灑在棉籽餅粉上充分拌勻，當餅粉中含水量達１５％時為宜，然后用塑料薄膜密封悶２４小時，即可飼用。
（4）用１５％的純堿溶液２４千克噴灑在１００千克棉籽餅粕上，充分拌勻用塑料薄膜密封悶５小時，然后蒸５０分鐘晾干；也可用濃度為ｌ％的氫氧化鈉溶液浸泡３～４小時后瀝去溶液，用清水沖洗干凈，晾干。１１０℃的高溫下蒸煮３～５分鐘。
