一定選擇高燥、寬敞、通風、干凈、不漏雨雪的房間存放，地面要墊上硬紙板隔潮。雨雪后及時檢查，有問題及時補救。
籽棉要曬干至12個水分以下，較長時間的保存水分要曬至10~11個水分，防止發熱變質。
不同級別的籽棉要分開存放，不要混堆。
不要在貯棉室的鄰屋生火做飯或生爐子取暖，避免煙熏降低籽棉品質。
棉花要自然堆放，不要踩壓，保持棉堆內的空氣流通。
盡量不要用塑料制品覆蓋，嚴禁狗貓進入，以免增加"三絲"的混入，降低籽棉質量，宜用純棉布包或邊角縫嚴的苫布覆蓋。
貯棉室要在晴天定期開窗通風。定期測量棉堆內的溫度，如發現升溫，即有發生霉變的可能，應立即開堆晾曬。
